Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb2Q9DBR4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apbb2Q9DBR4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apbb2Q9DBR4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb2Q9DBR4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apbb2Q9DBR4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms