Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6R2

Idh3a, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Idh3aQ9D6R2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Idh3aQ9D6R2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Idh3aQ9D6R2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Idh3aQ9D6R2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Idh3aQ9D6R2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Idh3aQ9D6R2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Idh3aQ9D6R2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Idh3aQ9D6R2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Idh3aQ9D6R2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Idh3aQ9D6R2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Idh3aQ9D6R2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Idh3aQ9D6R2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Idh3aQ9D6R2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Idh3aQ9D6R2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Idh3aQ9D6R2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Idh3aQ9D6R2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Idh3aQ9D6R2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Idh3aQ9D6R2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Idh3aQ9D6R2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Idh3aQ9D6R2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Idh3aQ9D6R2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Idh3aQ9D6R2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Idh3aQ9D6R2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Idh3aQ9D6R2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Idh3aQ9D6R2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Idh3aQ9D6R2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms