Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc81Q9D5W4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc81Q9D5W4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc81Q9D5W4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc81Q9D5W4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc81Q9D5W4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc81Q9D5W4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc81Q9D5W4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc81Q9D5W4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc81Q9D5W4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc81Q9D5W4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc81Q9D5W4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc81Q9D5W4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc81Q9D5W4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc81Q9D5W4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc81Q9D5W4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc81Q9D5W4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc81Q9D5W4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc81Q9D5W4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc81Q9D5W4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc81Q9D5W4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc81Q9D5W4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc81Q9D5W4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc81Q9D5W4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc81Q9D5W4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc81Q9D5W4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc81Q9D5W4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc81Q9D5W4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc81Q9D5W4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc81Q9D5W4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc81Q9D5W4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc81Q9D5W4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc81Q9D5W4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc81Q9D5W4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc81Q9D5W4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc81Q9D5W4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc81Q9D5W4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc81Q9D5W4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc81Q9D5W4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc81Q9D5W4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc81Q9D5W4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc81Q9D5W4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc81Q9D5W4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc81Q9D5W4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc81Q9D5W4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc81Q9D5W4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc81Q9D5W4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc81Q9D5W4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc81Q9D5W4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc81Q9D5W4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms