Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pus10Q9D3U0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pus10Q9D3U0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pus10Q9D3U0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus10Q9D3U0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus10Q9D3U0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pus10Q9D3U0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pus10Q9D3U0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pus10Q9D3U0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pus10Q9D3U0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pus10Q9D3U0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pus10Q9D3U0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pus10Q9D3U0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pus10Q9D3U0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pus10Q9D3U0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pus10Q9D3U0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pus10Q9D3U0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pus10Q9D3U0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pus10Q9D3U0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pus10Q9D3U0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pus10Q9D3U0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pus10Q9D3U0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pus10Q9D3U0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pus10Q9D3U0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pus10Q9D3U0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pus10Q9D3U0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms