Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ms4a4cQ9D3F6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a4cQ9D3F6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4cQ9D3F6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms