Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pramef12Q9D2F1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pramef12Q9D2F1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pramef12Q9D2F1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pramef12Q9D2F1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pramef12Q9D2F1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pramef12Q9D2F1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pramef12Q9D2F1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pramef12Q9D2F1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pramef12Q9D2F1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pramef12Q9D2F1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pramef12Q9D2F1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pramef12Q9D2F1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramef12Q9D2F1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramef12Q9D2F1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramef12Q9D2F1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pramef12Q9D2F1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pramef12Q9D2F1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pramef12Q9D2F1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pramef12Q9D2F1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pramef12Q9D2F1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pramef12Q9D2F1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pramef12Q9D2F1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pramef12Q9D2F1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pramef12Q9D2F1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramef12Q9D2F1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramef12Q9D2F1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramef12Q9D2F1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pramef12Q9D2F1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramef12Q9D2F1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramef12Q9D2F1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramef12Q9D2F1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramef12Q9D2F1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramef12Q9D2F1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pramef12Q9D2F1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramef12Q9D2F1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms