Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdca7Q9D0M2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdca7Q9D0M2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdca7Q9D0M2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdca7Q9D0M2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdca7Q9D0M2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdca7Q9D0M2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdca7Q9D0M2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdca7Q9D0M2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdca7Q9D0M2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdca7Q9D0M2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdca7Q9D0M2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdca7Q9D0M2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdca7Q9D0M2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdca7Q9D0M2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdca7Q9D0M2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdca7Q9D0M2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdca7Q9D0M2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdca7Q9D0M2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdca7Q9D0M2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdca7Q9D0M2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdca7Q9D0M2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdca7Q9D0M2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdca7Q9D0M2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdca7Q9D0M2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdca7Q9D0M2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdca7Q9D0M2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdca7Q9D0M2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdca7Q9D0M2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdca7Q9D0M2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdca7Q9D0M2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdca7Q9D0M2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cdca7Q9D0M2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdca7Q9D0M2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdca7Q9D0M2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdca7Q9D0M2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdca7Q9D0M2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdca7Q9D0M2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdca7Q9D0M2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdca7Q9D0M2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdca7Q9D0M2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdca7Q9D0M2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdca7Q9D0M2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdca7Q9D0M2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdca7Q9D0M2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdca7Q9D0M2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdca7Q9D0M2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdca7Q9D0M2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdca7Q9D0M2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdca7Q9D0M2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdca7Q9D0M2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdca7Q9D0M2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdca7Q9D0M2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdca7Q9D0M2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdca7Q9D0M2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdca7Q9D0M2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms