Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx47Q9CWX9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ddx47Q9CWX9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx47Q9CWX9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx47Q9CWX9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx47Q9CWX9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms