Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Sycp2Q9CUU3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC46.22■■■■■ 4.99
Sycp2Q9CUU3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Sycp2Q9CUU3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Sycp2Q9CUU3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
Sycp2Q9CUU3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
Sycp2Q9CUU3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
Sycp2Q9CUU3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
Sycp2Q9CUU3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
Sycp2Q9CUU3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
Sycp2Q9CUU3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
Sycp2Q9CUU3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
Sycp2Q9CUU3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
Sycp2Q9CUU3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
Sycp2Q9CUU3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.98
Sycp2Q9CUU3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC46.13■■■■■ 4.98
Sycp2Q9CUU3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
Sycp2Q9CUU3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
Sycp2Q9CUU3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
Sycp2Q9CUU3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Sycp2Q9CUU3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Sycp2Q9CUU3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC46.08■■■■■ 4.97
Sycp2Q9CUU3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
Sycp2Q9CUU3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Sycp2Q9CUU3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC46.07■■■■■ 4.97
Sycp2Q9CUU3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC46.06■■■■■ 4.96
Sycp2Q9CUU3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Sycp2Q9CUU3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
Sycp2Q9CUU3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
Sycp2Q9CUU3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
Sycp2Q9CUU3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
Sycp2Q9CUU3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Sycp2Q9CUU3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Sycp2Q9CUU3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Sycp2Q9CUU3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Sycp2Q9CUU3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Sycp2Q9CUU3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.95
Sycp2Q9CUU3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC45.94■■■■■ 4.95
Sycp2Q9CUU3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Sycp2Q9CUU3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
Sycp2Q9CUU3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
Sycp2Q9CUU3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
Sycp2Q9CUU3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
Sycp2Q9CUU3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
Sycp2Q9CUU3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
Sycp2Q9CUU3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Sycp2Q9CUU3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC45.87■■■■■ 4.93
Sycp2Q9CUU3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Sycp2Q9CUU3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Sycp2Q9CUU3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Sycp2Q9CUU3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Sycp2Q9CUU3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Sycp2Q9CUU3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
Sycp2Q9CUU3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Sycp2Q9CUU3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC45.81■■■■■ 4.92
Sycp2Q9CUU3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Sycp2Q9CUU3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Sycp2Q9CUU3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
Sycp2Q9CUU3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
Sycp2Q9CUU3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Sycp2Q9CUU3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Sycp2Q9CUU3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
Sycp2Q9CUU3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Sycp2Q9CUU3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
Sycp2Q9CUU3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
Sycp2Q9CUU3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
Sycp2Q9CUU3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Sycp2Q9CUU3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
Sycp2Q9CUU3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC45.69■■■■■ 4.9
Sycp2Q9CUU3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Sycp2Q9CUU3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC45.67■■■■■ 4.9
Sycp2Q9CUU3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Sycp2Q9CUU3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
Sycp2Q9CUU3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Sycp2Q9CUU3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Sycp2Q9CUU3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
Sycp2Q9CUU3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Sycp2Q9CUU3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
Sycp2Q9CUU3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
Sycp2Q9CUU3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Sycp2Q9CUU3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
Sycp2Q9CUU3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
Sycp2Q9CUU3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
Sycp2Q9CUU3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
Sycp2Q9CUU3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Sycp2Q9CUU3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Sycp2Q9CUU3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
Sycp2Q9CUU3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Sycp2Q9CUU3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.88
Sycp2Q9CUU3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Sycp2Q9CUU3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
Sycp2Q9CUU3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Sycp2Q9CUU3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
Sycp2Q9CUU3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
Sycp2Q9CUU3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC45.47■■■■■ 4.87
Sycp2Q9CUU3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
Sycp2Q9CUU3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Sycp2Q9CUU3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC45.45■■■■■ 4.87
Sycp2Q9CUU3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms