Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc43Q9CR29 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc43Q9CR29 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc43Q9CR29 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc43Q9CR29 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc43Q9CR29 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc43Q9CR29 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc43Q9CR29 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc43Q9CR29 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc43Q9CR29 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms