Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smim8Q9CQQ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim8Q9CQQ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim8Q9CQQ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim8Q9CQQ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim8Q9CQQ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms