Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ms4a6cQ99N08 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a6cQ99N08 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a6cQ99N08 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a6cQ99N08 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a6cQ99N08 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a6cQ99N08 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms