Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS1

Mmadhc, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type D homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MmadhcQ99LS1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MmadhcQ99LS1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MmadhcQ99LS1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MmadhcQ99LS1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MmadhcQ99LS1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MmadhcQ99LS1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MmadhcQ99LS1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155 ms