Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcf2Q99LE6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcf2Q99LE6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcf2Q99LE6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf2Q99LE6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcf2Q99LE6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcf2Q99LE6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.3 ms