Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TriobpQ99KW3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TriobpQ99KW3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TriobpQ99KW3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TriobpQ99KW3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TriobpQ99KW3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TriobpQ99KW3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TriobpQ99KW3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TriobpQ99KW3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TriobpQ99KW3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TriobpQ99KW3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TriobpQ99KW3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TriobpQ99KW3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TriobpQ99KW3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TriobpQ99KW3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TriobpQ99KW3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TriobpQ99KW3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TriobpQ99KW3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TriobpQ99KW3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TriobpQ99KW3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TriobpQ99KW3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TriobpQ99KW3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TriobpQ99KW3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms