Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlcd1Q99JT6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tlcd1Q99JT6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlcd1Q99JT6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tlcd1Q99JT6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlcd1Q99JT6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlcd1Q99JT6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms