Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mcoln1Q99J21 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mcoln1Q99J21 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mcoln1Q99J21 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mcoln1Q99J21 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mcoln1Q99J21 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mcoln1Q99J21 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Mcoln1Q99J21 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mcoln1Q99J21 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mcoln1Q99J21 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Mcoln1Q99J21 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mcoln1Q99J21 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mcoln1Q99J21 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mcoln1Q99J21 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mcoln1Q99J21 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mcoln1Q99J21 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Mcoln1Q99J21 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mcoln1Q99J21 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mcoln1Q99J21 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mcoln1Q99J21 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mcoln1Q99J21 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mcoln1Q99J21 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mcoln1Q99J21 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mcoln1Q99J21 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Mcoln1Q99J21 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mcoln1Q99J21 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mcoln1Q99J21 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mcoln1Q99J21 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mcoln1Q99J21 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mcoln1Q99J21 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mcoln1Q99J21 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mcoln1Q99J21 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mcoln1Q99J21 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcoln1Q99J21 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcoln1Q99J21 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcoln1Q99J21 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mcoln1Q99J21 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mcoln1Q99J21 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mcoln1Q99J21 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mcoln1Q99J21 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcoln1Q99J21 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcoln1Q99J21 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms