Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac11Q91WA3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hdac11Q91WA3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac11Q91WA3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac11Q91WA3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac11Q91WA3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms