Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE08

Fbxo33, F-box only protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo33Q8VE08 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fbxo33Q8VE08 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fbxo33Q8VE08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fbxo33Q8VE08 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fbxo33Q8VE08 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fbxo33Q8VE08 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fbxo33Q8VE08 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbxo33Q8VE08 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fbxo33Q8VE08 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fbxo33Q8VE08 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbxo33Q8VE08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbxo33Q8VE08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fbxo33Q8VE08 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fbxo33Q8VE08 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fbxo33Q8VE08 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fbxo33Q8VE08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fbxo33Q8VE08 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fbxo33Q8VE08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fbxo33Q8VE08 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fbxo33Q8VE08 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fbxo33Q8VE08 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fbxo33Q8VE08 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fbxo33Q8VE08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Fbxo33Q8VE08 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Fbxo33Q8VE08 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fbxo33Q8VE08 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Fbxo33Q8VE08 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Fbxo33Q8VE08 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fbxo33Q8VE08 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fbxo33Q8VE08 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fbxo33Q8VE08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Fbxo33Q8VE08 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fbxo33Q8VE08 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fbxo33Q8VE08 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fbxo33Q8VE08 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms