Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N0

Ccdc59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc59Q8R2N0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc59Q8R2N0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc59Q8R2N0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc59Q8R2N0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc59Q8R2N0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms