Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ltbp4Q8K4G1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ltbp4Q8K4G1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ltbp4Q8K4G1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ltbp4Q8K4G1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ltbp4Q8K4G1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ltbp4Q8K4G1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ltbp4Q8K4G1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ltbp4Q8K4G1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ltbp4Q8K4G1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ltbp4Q8K4G1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ltbp4Q8K4G1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ltbp4Q8K4G1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ltbp4Q8K4G1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ltbp4Q8K4G1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ltbp4Q8K4G1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ltbp4Q8K4G1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ltbp4Q8K4G1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Ltbp4Q8K4G1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ltbp4Q8K4G1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Ltbp4Q8K4G1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Ltbp4Q8K4G1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ltbp4Q8K4G1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ltbp4Q8K4G1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ltbp4Q8K4G1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ltbp4Q8K4G1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ltbp4Q8K4G1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ltbp4Q8K4G1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ltbp4Q8K4G1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ltbp4Q8K4G1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ltbp4Q8K4G1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ltbp4Q8K4G1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ltbp4Q8K4G1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ltbp4Q8K4G1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ltbp4Q8K4G1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ltbp4Q8K4G1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ltbp4Q8K4G1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Ltbp4Q8K4G1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ltbp4Q8K4G1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ltbp4Q8K4G1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ltbp4Q8K4G1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ltbp4Q8K4G1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ltbp4Q8K4G1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ltbp4Q8K4G1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Ltbp4Q8K4G1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ltbp4Q8K4G1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Ltbp4Q8K4G1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ltbp4Q8K4G1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ltbp4Q8K4G1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ltbp4Q8K4G1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ltbp4Q8K4G1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ltbp4Q8K4G1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ltbp4Q8K4G1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Ltbp4Q8K4G1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ltbp4Q8K4G1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ltbp4Q8K4G1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Ltbp4Q8K4G1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ltbp4Q8K4G1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ltbp4Q8K4G1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ltbp4Q8K4G1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ltbp4Q8K4G1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ltbp4Q8K4G1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ltbp4Q8K4G1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Ltbp4Q8K4G1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ltbp4Q8K4G1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ltbp4Q8K4G1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ltbp4Q8K4G1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ltbp4Q8K4G1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ltbp4Q8K4G1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ltbp4Q8K4G1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ltbp4Q8K4G1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ltbp4Q8K4G1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms