Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrtm1Q8K377 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm1Q8K377 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrtm1Q8K377 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrtm1Q8K377 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrtm1Q8K377 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms