Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkn3Q8K045 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkn3Q8K045 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkn3Q8K045 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkn3Q8K045 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pkn3Q8K045 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms