Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lin52Q8CD94 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin52Q8CD94 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Lin52Q8CD94 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lin52Q8CD94 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lin52Q8CD94 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lin52Q8CD94 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lin52Q8CD94 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lin52Q8CD94 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lin52Q8CD94 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms