Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9H6

Strip2, Striatin-interacting proteins 2, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip2Q8C9H6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip2Q8C9H6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Strip2Q8C9H6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Strip2Q8C9H6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip2Q8C9H6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Strip2Q8C9H6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strip2Q8C9H6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strip2Q8C9H6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strip2Q8C9H6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strip2Q8C9H6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strip2Q8C9H6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strip2Q8C9H6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strip2Q8C9H6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strip2Q8C9H6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strip2Q8C9H6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms