Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0M8

Dnai1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnai1Q8C0M8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dnai1Q8C0M8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dnai1Q8C0M8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dnai1Q8C0M8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dnai1Q8C0M8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dnai1Q8C0M8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Dnai1Q8C0M8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Dnai1Q8C0M8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Dnai1Q8C0M8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Dnai1Q8C0M8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dnai1Q8C0M8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dnai1Q8C0M8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Dnai1Q8C0M8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Dnai1Q8C0M8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Dnai1Q8C0M8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Dnai1Q8C0M8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Dnai1Q8C0M8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Dnai1Q8C0M8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Dnai1Q8C0M8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Dnai1Q8C0M8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Dnai1Q8C0M8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Dnai1Q8C0M8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Dnai1Q8C0M8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Dnai1Q8C0M8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Dnai1Q8C0M8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Dnai1Q8C0M8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dnai1Q8C0M8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms