Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc44a2Q8BY89 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc44a2Q8BY89 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a2Q8BY89 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms