Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E330017A01RikQ8BU47 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E330017A01RikQ8BU47 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E330017A01RikQ8BU47 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
E330017A01RikQ8BU47 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E330017A01RikQ8BU47 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms