Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc9Q8BJN4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc9Q8BJN4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fndc9Q8BJN4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fndc9Q8BJN4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fndc9Q8BJN4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc9Q8BJN4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc9Q8BJN4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc9Q8BJN4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc9Q8BJN4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc9Q8BJN4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc9Q8BJN4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc9Q8BJN4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc9Q8BJN4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc9Q8BJN4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc9Q8BJN4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms