Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smndc1Q8BGT7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smndc1Q8BGT7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smndc1Q8BGT7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smndc1Q8BGT7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms