Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpp38Q80UU2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpp38Q80UU2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpp38Q80UU2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpp38Q80UU2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpp38Q80UU2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpp38Q80UU2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpp38Q80UU2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpp38Q80UU2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpp38Q80UU2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpp38Q80UU2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpp38Q80UU2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpp38Q80UU2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpp38Q80UU2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpp38Q80UU2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpp38Q80UU2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpp38Q80UU2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms