Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rph3alQ768S4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rph3alQ768S4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rph3alQ768S4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rph3alQ768S4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rph3alQ768S4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms