Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp8b3Q6UQ17 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp8b3Q6UQ17 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp8b3Q6UQ17 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp8b3Q6UQ17 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp8b3Q6UQ17 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp8b3Q6UQ17 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp8b3Q6UQ17 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp8b3Q6UQ17 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp8b3Q6UQ17 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atp8b3Q6UQ17 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atp8b3Q6UQ17 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp8b3Q6UQ17 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp8b3Q6UQ17 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp8b3Q6UQ17 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp8b3Q6UQ17 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp8b3Q6UQ17 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp8b3Q6UQ17 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp8b3Q6UQ17 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp8b3Q6UQ17 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Atp8b3Q6UQ17 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atp8b3Q6UQ17 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp8b3Q6UQ17 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp8b3Q6UQ17 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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