Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpeQ6RT24 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpeQ6RT24 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpeQ6RT24 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpeQ6RT24 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpeQ6RT24 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpeQ6RT24 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpeQ6RT24 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpeQ6RT24 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpeQ6RT24 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpeQ6RT24 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpeQ6RT24 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpeQ6RT24 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpeQ6RT24 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpeQ6RT24 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpeQ6RT24 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpeQ6RT24 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpeQ6RT24 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpeQ6RT24 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpeQ6RT24 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpeQ6RT24 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpeQ6RT24 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms