Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1a2Q6PIE5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp1a2Q6PIE5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1a2Q6PIE5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1a2Q6PIE5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms