Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc57Q6PHN1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc57Q6PHN1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc57Q6PHN1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc57Q6PHN1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc57Q6PHN1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc57Q6PHN1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc57Q6PHN1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc57Q6PHN1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc57Q6PHN1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc57Q6PHN1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc57Q6PHN1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc57Q6PHN1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc57Q6PHN1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc57Q6PHN1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc57Q6PHN1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc57Q6PHN1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc57Q6PHN1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc57Q6PHN1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc57Q6PHN1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc57Q6PHN1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc57Q6PHN1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc57Q6PHN1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc57Q6PHN1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc57Q6PHN1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc57Q6PHN1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc57Q6PHN1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc57Q6PHN1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc57Q6PHN1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc57Q6PHN1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc57Q6PHN1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc57Q6PHN1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms