Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ttbk1Q6PCN3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ttbk1Q6PCN3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Ttbk1Q6PCN3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Ttbk1Q6PCN3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Ttbk1Q6PCN3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ttbk1Q6PCN3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ttbk1Q6PCN3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ttbk1Q6PCN3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ttbk1Q6PCN3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ttbk1Q6PCN3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ttbk1Q6PCN3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ttbk1Q6PCN3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Ttbk1Q6PCN3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ttbk1Q6PCN3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ttbk1Q6PCN3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ttbk1Q6PCN3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Ttbk1Q6PCN3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ttbk1Q6PCN3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ttbk1Q6PCN3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ttbk1Q6PCN3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ttbk1Q6PCN3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.7
Ttbk1Q6PCN3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Ttbk1Q6PCN3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Ttbk1Q6PCN3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ttbk1Q6PCN3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Ttbk1Q6PCN3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ttbk1Q6PCN3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ttbk1Q6PCN3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ttbk1Q6PCN3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ttbk1Q6PCN3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ttbk1Q6PCN3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ttbk1Q6PCN3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ttbk1Q6PCN3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ttbk1Q6PCN3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ttbk1Q6PCN3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ttbk1Q6PCN3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ttbk1Q6PCN3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ttbk1Q6PCN3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ttbk1Q6PCN3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ttbk1Q6PCN3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ttbk1Q6PCN3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ttbk1Q6PCN3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ttbk1Q6PCN3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ttbk1Q6PCN3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ttbk1Q6PCN3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Ttbk1Q6PCN3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ttbk1Q6PCN3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ttbk1Q6PCN3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Ttbk1Q6PCN3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ttbk1Q6PCN3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ttbk1Q6PCN3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ttbk1Q6PCN3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ttbk1Q6PCN3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ttbk1Q6PCN3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ttbk1Q6PCN3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ttbk1Q6PCN3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Ttbk1Q6PCN3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ttbk1Q6PCN3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Ttbk1Q6PCN3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ttbk1Q6PCN3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ttbk1Q6PCN3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms