Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2mQ6P6I6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2mQ6P6I6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2mQ6P6I6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2mQ6P6I6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Polr2mQ6P6I6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2mQ6P6I6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2mQ6P6I6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2mQ6P6I6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2mQ6P6I6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2mQ6P6I6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2mQ6P6I6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms