Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrnp200Q6P4T2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrnp200Q6P4T2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp200Q6P4T2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp200Q6P4T2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp200Q6P4T2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp200Q6P4T2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp200Q6P4T2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp200Q6P4T2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp200Q6P4T2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp200Q6P4T2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp200Q6P4T2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp200Q6P4T2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp200Q6P4T2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp200Q6P4T2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp200Q6P4T2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp200Q6P4T2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp200Q6P4T2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp200Q6P4T2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp200Q6P4T2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp200Q6P4T2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp200Q6P4T2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp200Q6P4T2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp200Q6P4T2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrnp200Q6P4T2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp200Q6P4T2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms