Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Podnl1Q6P3Y9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Podnl1Q6P3Y9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Podnl1Q6P3Y9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Podnl1Q6P3Y9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Podnl1Q6P3Y9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Podnl1Q6P3Y9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Podnl1Q6P3Y9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Podnl1Q6P3Y9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Podnl1Q6P3Y9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Podnl1Q6P3Y9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Podnl1Q6P3Y9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Podnl1Q6P3Y9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Podnl1Q6P3Y9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Podnl1Q6P3Y9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Podnl1Q6P3Y9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Podnl1Q6P3Y9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Podnl1Q6P3Y9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Podnl1Q6P3Y9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Podnl1Q6P3Y9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Podnl1Q6P3Y9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Podnl1Q6P3Y9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Podnl1Q6P3Y9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Podnl1Q6P3Y9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Podnl1Q6P3Y9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Podnl1Q6P3Y9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Podnl1Q6P3Y9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Podnl1Q6P3Y9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Podnl1Q6P3Y9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Podnl1Q6P3Y9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Podnl1Q6P3Y9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Podnl1Q6P3Y9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Podnl1Q6P3Y9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Podnl1Q6P3Y9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Podnl1Q6P3Y9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Podnl1Q6P3Y9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Podnl1Q6P3Y9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Podnl1Q6P3Y9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Podnl1Q6P3Y9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Podnl1Q6P3Y9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Podnl1Q6P3Y9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Podnl1Q6P3Y9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Podnl1Q6P3Y9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms