Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retreg2Q6NS82 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retreg2Q6NS82 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retreg2Q6NS82 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retreg2Q6NS82 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retreg2Q6NS82 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retreg2Q6NS82 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retreg2Q6NS82 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retreg2Q6NS82 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retreg2Q6NS82 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retreg2Q6NS82 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retreg2Q6NS82 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retreg2Q6NS82 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retreg2Q6NS82 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retreg2Q6NS82 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retreg2Q6NS82 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retreg2Q6NS82 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retreg2Q6NS82 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms