Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms