Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt72Q6IME9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt72Q6IME9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt72Q6IME9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt72Q6IME9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms