Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps72Q62481 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps72Q62481 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps72Q62481 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps72Q62481 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps72Q62481 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vps72Q62481 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps72Q62481 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps72Q62481 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps72Q62481 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps72Q62481 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps72Q62481 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps72Q62481 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps72Q62481 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps72Q62481 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps72Q62481 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps72Q62481 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps72Q62481 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps72Q62481 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps72Q62481 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps72Q62481 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps72Q62481 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms