Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AtmQ62388 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AtmQ62388 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AtmQ62388 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AtmQ62388 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AtmQ62388 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AtmQ62388 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AtmQ62388 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AtmQ62388 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AtmQ62388 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtmQ62388 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AtmQ62388 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AtmQ62388 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AtmQ62388 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AtmQ62388 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AtmQ62388 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AtmQ62388 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AtmQ62388 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AtmQ62388 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AtmQ62388 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AtmQ62388 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AtmQ62388 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AtmQ62388 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AtmQ62388 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AtmQ62388 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AtmQ62388 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtmQ62388 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AtmQ62388 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AtmQ62388 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AtmQ62388 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AtmQ62388 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtmQ62388 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtmQ62388 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AtmQ62388 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AtmQ62388 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms