Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema3bQ62177 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema3bQ62177 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3bQ62177 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3bQ62177 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3bQ62177 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms