Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zzef1Q5SSH7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zzef1Q5SSH7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zzef1Q5SSH7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zzef1Q5SSH7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zzef1Q5SSH7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zzef1Q5SSH7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zzef1Q5SSH7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zzef1Q5SSH7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms