Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc1Q5NCF2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc1Q5NCF2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc1Q5NCF2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms