Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SynaQ5G5D5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SynaQ5G5D5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SynaQ5G5D5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynaQ5G5D5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SynaQ5G5D5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms