Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clul1Q3ZRW6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clul1Q3ZRW6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clul1Q3ZRW6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clul1Q3ZRW6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Clul1Q3ZRW6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Clul1Q3ZRW6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clul1Q3ZRW6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clul1Q3ZRW6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clul1Q3ZRW6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clul1Q3ZRW6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clul1Q3ZRW6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clul1Q3ZRW6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clul1Q3ZRW6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clul1Q3ZRW6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clul1Q3ZRW6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clul1Q3ZRW6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clul1Q3ZRW6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clul1Q3ZRW6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clul1Q3ZRW6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clul1Q3ZRW6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clul1Q3ZRW6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clul1Q3ZRW6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clul1Q3ZRW6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clul1Q3ZRW6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clul1Q3ZRW6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clul1Q3ZRW6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clul1Q3ZRW6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clul1Q3ZRW6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms